„A kérdésem az lenne hogyan lehetne WMV-t lejátszani, mert a totem alapból nem ismeri fel. Vagy meglehet-e oldani hogy a FireFox az Mplayert használja lejátszóként, azt hiszem az lejátsza.”
Meglehet, de nem biztos, hogy jól fogsz járni vele, mert az mplayer „lista” esetén – ami a neten tipikus – csak egy bizonyos paraméterrel fog majd működni. Az mplayer plugin talán már tudja ezeket, viszont az automata hang/kép eszköz beállításokat nem, így számítani lehet a „fekete képre”. (Egyszóval nem a legmodernebb/felhasználóbarátabb cuccok.)
A javallat inkább kaffeiene, vagy gxine. (Talán mindkettő működik beépítve is, de ablakban biztosan.)

Firefoxban: Eszközök -> Beállítások -> Letöltések -> Műveletek megtekintése és szerkesztése.

Itt be tudod állítani, hogy milyen fájltípushoz melyik alkalmazást indítsa el.

Nézd meg a konfigurációt. Az enable-wmp értékének 1-nek kell lenni. Na meg nem árt a többi konfigurációs részt sem ellenőrizni, ha ezzel sem oldódik meg a problémád. Bővebben itt találsz róla információt:
http://mplayerplug-in.sourceforge.net/config.php

Az about:plugins-ban nem látsz vmi Totemhez kapcsolódót? Vagy magában a Plugins könyvtárban? Ha igen, távolítsd el, és akkor minden bizonnyal az mplayer-t fogja használni. Ha ez nem válik be, több ötletem nincs  :unsure: